Fernandinho dan Yaya Toure kembali memperkuat lapangan tengah City setelah absen pada laga medio pekan melawan Bayern akibat skorsing.
Pertandingan tak perlu berjalan lama sebelum insiden kontroversial terjadi.
City seharusnya mendapat penalti pada menit kedelapan setelah Jose Fonte dengan keras melanggar Sergio Aguero di kotak penalti.
Tapi, wasit Mike Jones secara membingungkan justru memberi sang Argentina hadiah kartu kuning karena dianggap melakukan simulasi.
Kedua tim lalu membahayakan gawang satu sama lain pada beberapa fase babak pertama.
Joe Hart harus waspada dengan dua kali melakukan penyelamatan gemilang dari Steven Davis dan Dusan Tadic pada menit ke-21.
Sembilan menit kemudian giliran Stevan Jovetic menguji cadangan Hart di timnas Inggris, Fraser Forster, dari jarak dekat. Sayang, usahanya dihentikan kombinasi sang penjaga gawang dan bek Toby Alderweireld di garis gawang.
Saints menciptakan peluang pertama setelah turun minum. Tadic melepas tembakan keras yang hanya melengkung tipis dari gawang Hart hanya dua menit setelah laga dimulai kembali.
Namun, sang Juara mengambil gol pertama laga pada menit ke-50. Aguero terlibat dalam gol dengan menyodorkan bola secara manis ke Yaya di luar kotak penalti.
Tanpa mengambil sentuhan, kapten timnas Pantai Gading ini langsung melepas tembakan roket melewati kiper Forster.
City kemudian menemui kemunduran kala Eliaquim Mangala mendapat kartu kuning kedua setelah menjatuhkan Shane Long yang telah berhadapan dengan Hart pada menit ke-73.
Bermain dengan 10 orang terbukti tidak bisa mengendurkan semangat juang penggawa City.
Tujuh menit kemudian, dua pemain pengganti City berkombinasi dengan baik untuk menghadirkan gol kedua Blues.
James Milner memberi umpan pendek ke Frank Lampad yang menjebol gawang Forster dengan tembakan akurat setelah mengambil sekali sentuhan.
Tak lama kemudian Aguero terlihat akan mencatatkan gol pada penampilan ke-100nya bagi City.
Pemain kelahiran Buenos Aires ini lolos dari jebakan off-side dan berada dalam situasi satu-versus-satu dengan Forster, tapi tangan kiper Saints tersebut menghentikan laju bola di kaki Kun.
Aguero tak lantas menyerah dan sang striker kembali memainkan peran penting untuk gol pamungkas Klub.
Ia kembali lolos dari penjagaan bek Southampton setelah City melancarkan serangan balik.
Kun melihat Gael Clichy dalam posisi lebih bagus dan menyodok bola melintasi gawang Forster yang langsung disambut Clichy dengan tembakan first time kaki kanan lemahnya ke pojok atas gawang Saints.
Ini adalah gol pertama bek asal Prancis itu sejak ia memperkuat City tiga tahun silam.
City harus menyudahi pertandingan dengan sembilan pemain setelah kapten Vincent Kompany keluar karena cedera pada fase-fase akhir pertandingan.
Kendati diakhiri dengan kekhawatiran, hasil ini membuat Blues mengudeta posisi kedua dari Southampton dan memangkas jarak dengan Chelsea di puncak menjadi enam poin.
