Sang gelandang, yang membuat penampilan internasional seniornya yang ke-62, bermain lebih dari satu jam sebelum digantikan oleh Julian Brandt dari Borussia Dortmund.
Die mannschaft akan merasa mereka seharusnya menang dengan margin yang lebih bagus setelah menguasai 72% penguasaan bola dan mencatatkan 18 tembakan ke gawang.
Tapi mereka harus menunggu hingga sepuluh menit terakhir untuk terobosan di Muscat, yang datang dari debutan, Niclas Fullkrug.
Kemenangan mewakili pertandingan terakhir Gundogan dan kawan-kawan sebelum Piala Dunia berlangsung.
Pencarian terakhir juara 2014 untuk sukses dimulai melawan Jepang pada hari Rabu 23 November, dengan pertandingan selanjutnya di Grup E melawan Spanyol dan Kosta Rika.
Ketika Jerman berhadapan dengan La Roja di pertandingan kedua mereka, itu bisa membuat Gundogan berhadapan dengan rekan setim City Aymeric Laporte dan Rodrigo.